Estragon verwendet man meist für Saucen, Salate, Fleisch- und Fischgerichte sowie zum Einlegen von Gurken. Er ist auch eine bekannte Senfzutat. Estragon wird eine belebende Wirkung nachgesagt, die vor allem gegen Frühjahrsmüdigkeit wirken soll. Das Gewürz ist frisch nur in den Sommermonaten erhältlich. Beim Kochen sollte man ihn vorsichtig verwenden, sein sehr aromatischer Geschmack entfaltet sich erst während des Garprozesses weshalb man Estragon am Besten mitgaren sollte.